Вопрос:

С 1 июля 2010 года наша организация ООО осуществляет свою деятельность в условиях Таможенного союза с Республикой Казахстан. В новых условиях оплата НДС за товар, перемещаемый через границу, производится в налоговые органы до 20 числа месяца следующего за отчетным периодом. Условием принятия НДС к возмещению является поданное нами заявление с пакетом документов и декларация за отчетный период, подтвержденные налоговыми органами. Отчитываясь за третий квартал 2010 года, в декларацию по налогу на добавленную стоимость по устному разрешению местных налоговых органов (краевых) нами была включена сумма косвенного налога к возмещению по товарам, ввезенным нами из Республики Казахстан в сентябре 2010 года. Сумма НДС по ввезенным товарам, составляющая 2369181 руб.00 коп., оплачена нами 04.10.2010, и заявление о подтверждении получено от налоговых органов 19.10.2010.

22 декабря 2010 года нам сообщают об отказе в сумме возмещения за третий квартал 2010 года на сумму оплаты НДС по косвенным налогам за сентябрь 2010 года и рекомендуют подать уточненную декларацию, в результате чего мы обязаны будем оплатить повторно 2369181 руб., а также штрафы и пени. Данное распоряжение поступает от краевых налоговых органов, и конкретной ссылки, по какому законодательству, приказу, распоряжению, мы не получили.