Реформирование структуры органов государственной власти города Санкт-Петербурга происходило в несколько этапов. Первоначально система органов государственной власти была изменена Указом Президента Российской Федерации от 21 декабря 1993 года N 2252, в котором был реализован принцип разделения властей.

25 декабря 1993 года вступила в силу Конституция Российской Федерации.

Согласно пункту "н" части 1 статьи 72 Конституции Российской Федерации установление общих принципов организации системы органов государственной власти находится в совместном ведении Российской Федерации и субъектов Российской Федерации. Данное положение нашло отражение в Федеральном законе от 6 октября 1999 года N 184-ФЗ "Об общих принципах организации законодательных (представительных) и исполнительных органов государственной власти субъектов Российской Федерации", который устанавливает, в частности, основы правового положения глав исполнительной власти субъектов Российской Федерации (см. ст.18 Закона).