Высшая школа экономики Министерства науки, высшей школы и технической политики Российской Федерации была создана в соответствии с постановлением Правительства Российской Федерации от 27 ноября 1992 г. N 917 "О создании Высшей школы экономики", зарегистрирована Департаментом общественных и межрегиональных связей 15 ноября 1994 г., (свидетельство N 2868) и внесена в общегородской реестр г. Москвы 18 декабря 1996 г. под номером 245319.

В соответствии с постановлением Правительства Российской Федерации от 16 июля 1994 г. N 839 "О научно-исследовательских и учебных организациях, подведомственных Министерству экономики Российской Федерации" Высшая школа экономики Государственного комитета Российской Федерации по высшему образованию переименована в Высшую школу экономики Министерства экономики Российской Федерации и Государственного комитета Российской Федерации по высшему образованию.

В соответствии с приказом Министерства общего и профессионального образования Российской Федерации от 10 октября 1996 г. N 189 "О переименовании Высшей школы экономики в Высшую школу экономики (государственный университет)" Высшая школа экономики Министерства экономики Российской Федерации и Государственного комитета Российской Федерации по высшему образованию переименована в Высшую школу экономики (государственный университет) Министерства экономики Российской Федерации и Министерства общего и профессионального образования Российской Федерации.