Порядок отражения в бухгалтерском учете операций с векселями

  Вопрос:

Мы - малое предприятие. Работаем по оплате и по кассовому методу.  За выполненные работы получили  в феврале 2000 года простой вексель со сроком оплаты в мае 2000 года. Этот вексель мы реализовали в тот же день с дисконтом 11000 руб. Вексель, полученный в июне 2000 года со сроком оплаты в июле 2001 года мы реализовали в сентябре 2000 года  с дисконтом 24000 руб.

Аналогичных ситуаций было всего 5. В результате мы недополучили за счет дисконта более 100 000 руб. Налоги были оплачены с полученных средств.   Нужно  ли было оплатить НДС со всей суммы или с оплаченной части?  Консультант сказала, что налоги оплачены правильно, но недополученную сумму надо списать из прибыли прошлых лет проводкой 88 - 62. Но это, во-первых, нелогично, т.к. мы эту сумму никогда уже не получим, а во-вторых, закрывает нам дальнейшие операции с векселями т.к. денег на 88 счете просто не будет. Векселя, предполагается, мы будем еще получать. Суммы будут расти, но и сроки погашения уже превышают год, поэтому дисконт должен быть еще больше, а ждать невозможно. Подскажите, как нам быть в этой ситуации?